Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD8P13378 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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