Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRIQ1Q96JM4 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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