Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTF1Q16619 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms