Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
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