Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
USF2Q15853 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms