Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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