Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms