Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079355.2-201ENST00000440057 190 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P24-201ENST00000441091 490 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106017.1-203ENST00000447506 392 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010982.1-201ENST00000450325 465 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354676.1-201ENST00000458047 368 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL645P-201ENST00000496148 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MEF2BNBP1-201ENST00000502742 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG1L13P-201ENST00000518201 521 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000759.1-201ENST00000531086 397 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007406.2-201ENST00000540868 503 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018552.4-201ENST00000563251 556 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136944.3-202ENST00000567422 509 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4688-201ENST00000577966 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005209.1-201ENST00000579621 289 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX28-201ENST00000610938 1233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006435.3-201ENST00000611041 203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NEAT1_1.1-201ENST00000620348 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ILK-216ENST00000627400 111 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RUVBL2-212ENST00000627972 1065 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP9-1-204ENST00000635603 369 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BEND3P2-201ENST00000414425 2254 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AIF1L-207ENST00000372309 3515 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01346-201ENST00000412674 3242 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP45-202ENST00000426543 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592164.1-201ENST00000562814 1976 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO2-201ENST00000290246 3669 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1324-203ENST00000369939 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HHAT-206ENST00000537898 3446 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF438-205ENST00000436087 3164 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC078846.1-201ENST00000608694 7083 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC6-205ENST00000626395 2906 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP1A1-201ENST00000379727 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023790.2-201ENST00000543321 2403 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH13-202ENST00000428848 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC11A2-205ENST00000545993 1937 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF550-201ENST00000325134 4305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LPL-201ENST00000311322 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF4L1-201ENST00000333141 4772 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CD22-203ENST00000419549 2642 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 THY1-201ENST00000284240 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV2-201ENST00000338560 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LGR5-203ENST00000540815 2800 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00461-212ENST00000511014 3539 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms