Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms