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| CTXN3 | Q4LDR2 | OR8K4P-201 | ENST00000534608 | 872 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC011595.3-201 | ENST00000546699 | 632 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC012404.2-201 | ENST00000558572 | 481 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | OR52A4P-201 | ENST00000472867 | 958 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AL450336.1-201 | ENST00000605180 | 586 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL583856.2-201 | ENST00000606298 | 543 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | 5_8S_rRNA.1-201 | ENST00000614365 | 152 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C8orf89-202 | ENST00000624510 | 658 nt | APPRIS P2 TSL 3 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CDRT1-208 | ENST00000630868 | 794 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NOSTRIN-206 | ENST00000444448 | 2537 nt | TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTFR1-203 | ENST00000458689 | 2500 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IL1RL1-201 | ENST00000233954 | 2058 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SERPINA7-202 | ENST00000372563 | 1600 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C3orf67-AS1-202 | ENST00000482372 | 2203 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FOXP2-209 | ENST00000393498 | 2617 nt | TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CEP97-201 | ENST00000341893 | 8361 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PDE4D-205 | ENST00000360047 | 3122 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093535.2-201 | ENST00000624769 | 2326 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | R3HDM1-203 | ENST00000409606 | 3673 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CUL4B-204 | ENST00000404115 | 3264 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C1orf112-202 | ENST00000359326 | 4002 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C9orf153-204 | ENST00000613665 | 1738 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KARSP3-201 | ENST00000571212 | 1504 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | COPB2-205 | ENST00000507777 | 3034 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C6-202 | ENST00000337836 | 3551 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF567-203 | ENST00000585696 | 3734 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CFH-206 | ENST00000630130 | 1658 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DNAJC12-201 | ENST00000225171 | 1201 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MLIP-203 | ENST00000370877 | 1234 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-906P-201 | ENST00000384700 | 70 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL592310.1-201 | ENST00000414330 | 671 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |