Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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