Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
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