Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms