Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SCAPQ12770 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms