Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMOD1P29536 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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LMOD1P29536 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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LMOD1P29536 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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