Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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