Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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