Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARP3Q9Y6F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms