Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNPO3Q9Y5L0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNPO3Q9Y5L0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms