Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDP1Q9Y5B0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDP1Q9Y5B0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms