Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms