Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms