Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms