Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms