Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms