Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK2Q9UPX8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms