Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms