Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms