Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNL1Q9UK58 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms