Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNMT3LQ9UJW3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms