Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG3Q9UJ98 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG3Q9UJ98 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms