Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGEF1Q9UJ41 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms