Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms