Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUX4Q9UBX2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms