Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEF1Q9UBV8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms