Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms