Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms