Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL9Q9P2J3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms