Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms