Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms