Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMILIN3Q9NT22 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms