Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms