Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms