Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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ATP13A2Q9NQ11 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP13A2Q9NQ11 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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