Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRHQ9HD43 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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