Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms