Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms