Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF541Q9H0D2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms