Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms