Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms