Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPL3Q9BY60 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms